Eventuell kommt er durch die falsche Luftmasse im Momentenmodell durcheinander, aber dann wäre das Problem wohl eher auch bei anderen Schaltvorgängen.
Ich bin mir gerade auch nicht sicher, ob man das Getriebesteuergerät nicht auch separat auslesen müsste. Im Motorsteuergerät sind nicht zwingend alle Fehler hinterlegt.
Eventuell nach der Behebung der anderen Fehler die Adaptionswerte des Getriebes erneut zurücksetzen, obwohl ich mir davon auch keine Signifikanten Änderungen vorstellen kann.
AGR würde ich erst mal nichts machen, kann wie gesagt vom falschen LMM Signal kommen.
Hast du mal im Betrieb angerufen, die das Getriebe gespült haben?
Eventuell können die mal die Mechanik/Getriebewerte prüfen?
Grüße